控制科学与工程学院是山东大学成立最早的工科学院之一。其前身是创建于1949年的原山东工学院电机工程系。1952年，全国高校院系调整，原山东大学电机专业调整并入。随着科学技术的不断进步，电机工程系各专业逐渐形成新兴学科并相继独立建院。1989年山东工学院电机工程系更名为山东工业大学自动化工程系。2001年1月新山东大学成立后，自动化工程系更名为控制科学与工程学院。
控制科学与工程学院现有教职工 152人，其中教授44人，博士生导师26人，双聘院士 1 人，教育部***特聘教授2人、讲座教授1人，国家***基金获得者1人，"新世纪***万人才工程"国家级人选1人，山东省泰山学者特聘教授3人、泰山学者海外特聘教授3人，建有"复杂工业系统节能与先进控制"教育部创新团队以及教育部新世纪优秀人才3人，山东省"***"第一层次入选者1人，齐鲁青年学者2人。另外还有10人是国务院***获得者和山东省有突出贡献的中青年专家。
控制科学与工程学院建有"控制理论与控制工程"国家重点学科，拥有"控制科学与工程"、"生物医学工程"2个一级学科博士学位授予权和博士后流动站以及"控制理论与控制工程"、"电力电子与电力传动"、"检测技术与自动化装置"、"模式识别与智能系统"、"系统工程"、"导航制导与控制"、"物流工程"7个二级学科博士点，"控制理论与控制工程"、"电力电子与电力传动"、"检测技术与自动化装置"、"模式识别与智能系统"、"系统工程"、"生物医学工程"、"仪器科学与技术"、"物流工程"和"交通运输工程"9 个硕士学位授权点，并设有"控制工程"、"仪器仪表工程"、"生物医学工程"和"物流工程"4 个工程硕士学位授权点和"控制理论与控制工程"、"生物医学工程"2个教育硕士学位授予权。"电力电子与电力传动"学科是山东省"十一五""十二五"重点强化建设学科，"检测技术与自动化装置"是山东省"十二五"重点建设学科。
控制科学与工程学院设有"自动化"、"测控技术与仪器"、"生物医学工程"和"物流工程"4 个本科教学系以及相应的4个本科专业。其中，自动化专业是国家级特色专业、山东省品牌专业，并已通过国家工程教育专业认证。生物医学工程专业是山东省品牌专业。
